En el sector medioambiental, NUTRIMENTEC desarrolla proyectos completos de tratamiento de aguas residuales, vertidos y gases, tanto para su posterior vertido a cauce público o riego, como para su aprovechamiento en la producción de biogás.
Entre las metodologías empleadas, se desarrollan industrialmente tratamientos de alto nivel, como la filtración tangencial para el tratamiento de efluentes (micro, ultra y nanofiltración), sistemas de oxidación fotocatalítica, electrofloculación, secado de fangos y aprovechamiento energético, etc.